| No | Pimpinan | | Periode |
| 1 | dr. Arief Yulizar, MARS | : | 15 Desember 1995 s/d 31 Oktober 2005 |
| 2 | dr. Retno Ariza S,Sp.P | : | 01 November 2005 s/d 31 Agustus 2006 |
| 3 | dr. Th. Medy Prabaningsih | : | 01 September 2006 s/d 31 April 2007 |
| 4 | dr. Nurlis Mahmud, M.M. | : | 02 Oktober 2007 s/d 31 Oktober 2012 |
| 5 | dr. Endang Sulistyoningrum | : | 01 Desember 2012 s/d 28 Februari 2015 |
| 6 | dr. Priyo Widodo, M. Kes | : | 01 Maret 2015 s/d 28 Februari 2022 |
| 7 | dr. Arsitya Nayana Citta | : | 01 Maret 2022 s/d 31 Juli 2024 |
| 8 | dr. Stepanus Agung L, Sp.PD.,M.H. | : | 01 Agustus 2024 s/d 30 September2025 |
| 9 | drg. Geovanni Hanung M A, M.P.H. | : | 01 Oktober 2025 s/d Sekarang |